ISES inicia la preparatoria incorporada a la UAEMex en 1997, otorgándole la clave Nº 099.

Con el propósito de ofrecer una alternativa más en educación media superior, inicia en el 2005 la preparatoria incorporada a la SEP.

Es una alternativa educativa que permite concluir el bachillerato, para así, poder continuar con estudios de nivel superior en cualquier institución educativa.